16S рРНК

Вторичная структура 16S рРНК E. coli 16S рРНК – один из трех типов рибосомной РНК (рРНК), локализующиеся в рибосомах прокариот. Имеют среднюю величину среди этих рРНК. Константа седиментации равна 16S (единиц Сведберга), для других рРНК константы уровне 5 и 23 S. В состав 16S рРНК входит 1600 нуклеотидов. У эукариот существуют аналогичные ей 18S рРНК, состоящие из 2500 нуклеотидов.
Атомная структура 30S Subunit в Thermus thermophilus. Протеины показано синим цветом, в то время как единичную полоску РНК показано оранжевым. Рибосомы и РНК присутствуют во всех без исключения клетках, а также некоторых органеллах эукариот (митохондрии, хлоропласты), т.е. эти структуры характеризуются древнейшим происхождением. Их функции всегда одинаковы, а первичная структура имеет высокую степень консервативности. Также рРНК находятся вне действия естественного отбора, поэтому молекулы эволюционируют только в результате спонтанных мутаций и количество этих мутаций может служить критерием эволюционной расстояния между организмами.
Из трех типов рРНК 16S и 18S удобнее анализировать, к настоящему времени изучена последовательность нуклеотидов в 16S и 18S рРНК для многих сотен видов из разных царств живой природы. На основании полученных данных выделено три группы эволюционно сходных организмов, получивших высший ранг доменов. Это:

Эукариоты (но не их органеллы),
Бактерии (а также митохондрии и хлоропласты эукариот),
Археи.

Исследования родства среди бактерий показали наличие 10 эволюционных ветвей, причем в 5 из них обнаружены фотосинтезирующие организмы. То есть они намного более родственны другим нефотосинтезуючим бактериям, чем друг другу. Эти открытия заставляют по-новому смотреть на эволюцию одноклеточных организмов и возникновение фотосинтеза.